La version 1 .0 de la Collection Chimique Discngine est maintenant disponible ! C’est collection est intégrée à Pipeline Pilot (Accelrys Software Inc.) et inclut :
Pharmacophore Graph : cette méthode, présentée en début d’année à la conférence des utilisateurs Accelrys à San Diego, a été conçue pour découvrir de nouvelles entités chimiques actives à partir de molécule(s) connue(s). Deux composants ont été ajoutés à la collection, permettant de convertir les graphes au format texte et d’améliorer la vitesse de recherche d’un facteur quatre.
Similarité : recherche rapide par similarité incluant différentes fonctions de score, recherche récursive par similarité chimique et calcul de coordonnées d’une carte de similarité chimique.
Smiles et Smarts : permet de créer des molécules à partir d’une liste de chaines Smiles, de filtrer une base de données chimiques par sous structures à partir d’une liste de motifs Smarts. Les chaines Smiles et motifs Smarts sont directement intégrés dans les paramètres du composant, facilitant le déploiement sur plusieurs serveurs.
Utilitaires : recherche de la première occurrence d’un paramètre et définition d’une clé d’enregistrement, cryptage par MD5 ou SHA.
La collection chimique discngine est disponible sur demande à contact@discngine.com pour une période d’évaluation. Cette collection nécessite la version 7.0 ou ultérieure de Pipeline Pilot.
Rejoignez nous au 6ème salon "Annual Compound Management & Integrity" à Londres du 19 au 20 mai.
Cette application a pour but de démontrer l'utilité des graphes pharmacophoriques dans la recherche de nouvelles entités chimiques actives. Le but est de découvrir des molécules ayant une structure assez différente de la molécule de référence mais possédant les mêmes propriétés pharmacophoriques. Cette
méthode réduit la structure moléculaire en un graphe pharmacophorique en regroupant les atomes ayant des propriétés pharmacophoriques semblables ou appartenant à un même groupe fonctionnel.
Demo
